В систему Министерства входят:
— центральный аппарат;
— Министерство строительства Республики Каракалпакстан, главные управления строительства областей и города Ташкента;
— Инспекция по контролю в сфере строительства;
— территориальные инспекции по контролю в сфере строительства;
— Государственное унитарное предприятие «Экспертиза градостроительной документации»;
— Республиканский центр стандартизации в строительстве;
— Центр технического нормирования в строительстве;
— Центр по развитию информационно-коммуникационных технологий в сфере строительства;
— Ташкентский архитектурно-строительный институт;
— Самаркандский государственный архитектурно-строительный институт;
— техникумы по профилю архитектуры и строительства;
— колледжи архитектурно-строительного профиля;
— консалтинговые центры по организации конкурсных торгов;
— издательский дом «Ўзбекистон бунёдкори»;
— журнал «Ўзбекистон архитектураси ва қурилиши».